Metotreksat to lek stosowany w leczeniu uogólnionej postaci łuszczycy pospolitej, włącznie z łuszczycowym zapaleniem stawów, a także chorób autoimmunologicznych, np. reumatoidalnego zapalenia stawów. Może być również stosowany w skojarzonym leczeniu wielolekowych nowotworów złośliwych i ostrych białaczek, kiedy występują wskazania do leczenia doustnego. Metotreksat powinni przepisywać wyłącznie lekarze, którzy mają doświadczenie w jego stosowaniu.